WP4 - Biomarqueurs des tumeurs SNP

Co-Responsables :

B. Dubois (PhD, CLB, UMR Inserm1052/CNRS 5286)

V. Desestret (MD, PhD, UMR MeLis/Inserm U1314/CNRS 5284)

Partenaires: FHU, CLB, ICM, LBBE

Les auto-anticorps (Ac) sont des biomarqueurs hautement spécifiques du SNP et des EA. Cependant, le rôle de ces Ac dans les mécanismes de la maladie peut varier selon la localisation de l'antigène identifié. Dans ces maladies paranéoplasiques, les lymphocytes T sont supposés être les principaux effecteurs immunitaires de l'attaque immunitaire cérébrale. Cependant, les antigènes reconnus par ces lymphocytes T sont inconnus ainsi que les mécanismes conduisant à leur activation dans les tumeurs. De plus, nous ne pouvons pas exclure l'implication d'autres Ac non encore identifiés et reflétant peut-être directement la réponse immunitaire anti-tumorale déclenchant le SNP

Nos données préliminaires ont montré que les cellules tumorales des patients atteints de SNP peuvent entraîner la réaction auto-immune par des altérations génétiques spécifiques des cellules tumorales conduisant à la création de néoépitopes dans les antigènes onconeuraux.

L'objectif de ce WP est de caractériser ces altérations génétiques tumorales et le microenvironnement afin d'identifier les mécanismes de rupture de tolérance, les caractéristiques de la réponse immunitaire pathogène et de nouveaux antigènes onconeuraux.

Tâche 4.1 : Caractérisation des altérations moléculaires des tumeurs du SNP

Objectif : Utiliser plusieurs approches (CGH, RNAseq, analyse de l'exome entier, NGS transcriptomique) pour identifier dans d'autres tumeurs associées au SNP, les anomalies moléculaires des cellules tumorales conduisant à une réaction immunitaire.

Tâche 4.2 : Caractérisation de la réponse immunitaire dans les tumeurs du SNP

Objectif : Caractériser les bras cellulaires et humoraux de l'immunité adaptative, qui, seuls ou ensemble, peuvent contribuer aux troubles cérébraux auto-immuns, et comparer cette réaction immunitaire dans différents types de tumeurs du SNP.

Tâche 4.3 : Caractérisation de nouveaux néoantigènes dans les tumeurs du SNP

Objectif : Identifier les néo-Ag putatifs qui seront utilisés pour identifier de nouveaux Ac associés au SNP et des réponses spécifiques des cellules T/B afin de déterminer les déclencheurs immunitaires pour les différentes cibles d'auto-anticorps qui pourraient expliquer le SNP.

Tâche 4.4 : Profilage de la réactivité de l'Abs dans les tumeurs fraîches du SNP pour identifier de nouveaux Ag onconeuraux

Objectif : Cribler les spécificités Ag des Ac produits au sein du microenvironnement tumoral afin d'identifier de potentiels nouveaux Ag onconeuraux dans le SNP.

Tâche 4.5 : Caractérisation de la diversité clonale des cellules immunitaires dans les tumeurs du SNP

Objectif : Mieux comprendre la réponse immunitaire dans le SNP et caractériser certaines spécificités qui pourraient être utilisées pour développer des modèles animaux.